configura el dominio para que apunte directamente a esa carpeta a la de elgg o bien mueve todo el contenido a una carpeta con nivel superior, y la carpeta de archivos o de datos , por seguridad devbeias ponerla fuera del directorio web para impedir el acceso a ella.

por ejemplo si tienes pones la instalación de elgg en c:/servidor/www/ donde www es el raiz del servidor web, pues la de datos la colocas en c:/servidor/datos/ el php igualmente tendra acceso a ella, después en tu instalación en el archivo engine/settings.php configura la nueva ruta , corre el upgrade y limpia cache y listo todo en raiz de tu dominio y con los datos digamos fuera de peligro.

Hola,
tan solo tienes que cambiar la ruta en tu base de datos, ya que en la instalación de elgg, te obliga a ponerla un directorio despues del principal.

http://www.oranyero.com/groups/profile/74/grupo-elgg

Un saludo.

Solucionado el problema!! Gracias Lostmon y Oranyero!! Buen año para todos!!!