Tach zusammen,
jetzt war ich ja schon fast soweit mein komplettes Projekt hin zu schmeissen weil bei vielen Leuten die Registrierung nicht funktioniert hat. Vornehmlich bei leuten die Emails über Webaccounts wie gmx, gmail, web.de usw. haben.

Das Problem war das der Link mit Sonderzeichen zugepflastert war und somit die Daten bei der Elggseite nicht gefunden werden konnten.

Lösung:
Umstellung von charset von UTF-8 auf ANSI.

Zu finden in:
engine/lib/notification.php -> Zeile 268

Ändern in:
. "Content-Type: text/plain; charset=ANSI; format=flowed{$header_eol}"

Und schon klappt alles wunderbar! Die Angabe ist natürlich ohne Gewähr, aber vielleicht für den ein oder anderen Hilfreich.